Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,722 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 MARCH2-206ENST00000601283 747 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 EIF4E3-201ENST00000295612 2764 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PXK-206ENST00000463280 2825 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 OTUD1-201ENST00000376495 2933 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 OSTC-201ENST00000361564 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.84
LRRIQ1Q96JM4 PCID2-203ENST00000375457 2372 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ITGA9-AS1-209ENST00000450990 562 ntTSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
LRRIQ1Q96JM4 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
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