Protein–RNA interactions for Protein: Q92629

SGCD, Delta-sarcoglycan, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGCDQ92629 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PPP2R5D-202ENST00000394110 2894 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 FAM167B-201ENST00000373582 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
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SGCDQ92629 MTA1-202ENST00000405646 2709 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
SGCDQ92629 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
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