Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z2E3

APTX, Aprataxin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 356 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APTXQ7Z2E3 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 BVES-AS1-203ENST00000580511 853 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC124016.1-202ENST00000609575 619 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 BMP8B-201ENST00000372827 4822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 ZBP1-202ENST00000395822 2073 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 TTLL5-219ENST00000556977 1961 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.62
APTXQ7Z2E3 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SORCS3-201ENST00000369699 5530 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 IFI27L1-206ENST00000554562 571 ntTSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 DHRS2-210ENST00000611765 1287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 KIAA1324L-208ENST00000450689 6841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
APTXQ7Z2E3 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms