Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTB9

RNF220, E3 ubiquitin-protein ligase RNF220, humanhuman

Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF220Q5VTB9 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MRI1-201ENST00000040663 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 DCTN3-209ENST00000477738 713 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 C21orf59-201ENST00000290155 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 BTNL9-202ENST00000376841 1626 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AC093827.2-201ENST00000512654 315 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 FDXR-205ENST00000544854 1827 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 AL596275.1-201ENST00000423464 877 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
RNF220Q5VTB9 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms