Protein–RNA interactions for Protein: Q15642

TRIP10, Cdc42-interacting protein 4, humanhuman

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Length 601 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP10Q15642 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 BCL7B-206ENST00000455335 985 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 REXO1L12P-201ENST00000622156 912 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NXNL2-202ENST00000375855 1457 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 BICD2-202ENST00000375512 4636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NTAN1-201ENST00000287706 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
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TRIP10Q15642 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
TRIP10Q15642 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
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