Protein–RNA interactions for Protein: Q12829

RAB40B, Ras-related protein Rab-40B, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB40BQ12829 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
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RAB40BQ12829 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
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RAB40BQ12829 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RAB40BQ12829 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
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