Protein–RNA interactions for Protein: Q07001

CHRND, Acetylcholine receptor subunit delta, humanhuman

Predictions only

Length 517 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNDQ07001 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 HMGN1P19-201ENST00000436976 333 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC129492.6-201ENST00000611383 1305 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ATP6AP2-224ENST00000637327 1929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CHRNDQ07001 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KCNH2-203ENST00000430723 2648 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 HGFAC-201ENST00000382774 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 PAX1-205ENST00000613128 5352 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 LINC01097-201ENST00000627163 2122 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
CHRNDQ07001 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms