Protein–RNA interactions for Protein: Q01650

SLC7A5, Large neutral amino acids transporter small subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 507 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC7A5Q01650 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 GALNT10-203ENST00000425427 4344 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PACRGL-207ENST00000502938 810 ntTSL 4 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ITM2C-201ENST00000326407 1888 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MSGN1-201ENST00000281047 606 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PSMD9-208ENST00000542602 516 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 AL365259.1-203ENST00000451660 707 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ZNF561-AS1-202ENST00000586614 568 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 PPP1R21-206ENST00000449090 3049 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
SLC7A5Q01650 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms