Protein–RNA interactions for Protein: P63261

ACTG1, Actin, cytoplasmic 2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTG1P63261 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GRB7-202ENST00000394204 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MRPL24-202ENST00000368211 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 BUB3-202ENST00000368859 667 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TSC2-202ENST00000350773 5532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RNF32-201ENST00000311822 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 PALM-201ENST00000264560 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ACTG1P63261 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms