Protein–RNA interactions for Protein: P54753

EPHB3, Ephrin type-B receptor 3, humanhuman

Predictions only

Length 998 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHB3P54753 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 SLC25A6P5-201ENST00000435663 894 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
EPHB3P54753 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AL162231.1-204ENST00000423809 477 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CEND1P1-201ENST00000451006 455 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC074386.1-202ENST00000463561 864 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SNAP91-201ENST00000195649 4434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SNAP91-204ENST00000369694 4449 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ETV2-204ENST00000403402 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
EPHB3P54753 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms