Protein–RNA interactions for Protein: P41229

KDM5C, Lysine-specific demethylase 5C, humanhuman

Predictions only

Length 1,560 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KDM5CP41229 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NKX1-2-201ENST00000451024 3364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SCARF2-203ENST00000623402 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MON1B-202ENST00000439557 1759 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CD40-207ENST00000620709 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RGN-204ENST00000457380 2041 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 TMEM235-201ENST00000374946 2409 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 HEBP2-202ENST00000448741 661 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
KDM5CP41229 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 ICA1-206ENST00000402384 2458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 RNF146-203ENST00000368314 2369 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
KDM5CP41229 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.2 ms