Protein–RNA interactions for Protein: P35638

DDIT3, DNA damage-inducible transcript 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 169 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDIT3P35638 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.37■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CNTNAP3B-203ENST00000377561 5379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TMEM64-204ENST00000519519 873 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AC005944.1-201ENST00000592758 564 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
DDIT3P35638 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms