Protein–RNA interactions for Protein: P35236

PTPN7, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 7, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN7P35236 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NUDT9-201ENST00000302174 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL161669.1-201ENST00000559843 386 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CRB3-203ENST00000598494 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CFC1-203ENST00000621673 1444 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
PTPN7P35236 SHBG-201ENST00000340624 1311 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 AC010632.1-201ENST00000590376 572 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
PTPN7P35236 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.1 ms