Protein–RNA interactions for Protein: P29353

SHC1, SHC-transforming protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHC1P29353 AC097374.2-201ENST00000618617 1306 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DHRS7B-206ENST00000579303 1479 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SHC1P29353 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 BMPER-201ENST00000297161 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TSR2-201ENST00000375151 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 METTL21C-201ENST00000267273 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 FICD-205ENST00000552758 603 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 C1orf43-210ENST00000640799 1287 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SHC1P29353 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHC1P29353 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SHC1P29353 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 PRMT2-201ENST00000291705 1011 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 LGI4-202ENST00000392225 2891 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SHC1P29353 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 MYO1B-202ENST00000339514 5026 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
SHC1P29353 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms