Protein–RNA interactions for Protein: P13984

GTF2F2, General transcription factor IIF subunit 2, humanhuman

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2F2P13984 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CALML5-201ENST00000380332 859 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CLSTN1-201ENST00000361311 4647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LINC01568-207ENST00000641790 1380 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSTD1-202ENST00000368023 574 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ACP1-205ENST00000407983 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TMEM53-201ENST00000372235 890 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 RNF121-203ENST00000393713 2132 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
GTF2F2P13984 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.7 ms