Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBR4

LHX3, LIM/homeobox protein Lhx3, humanhuman

Predictions only

Length 397 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX3Q9UBR4 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GPR89P-201ENST00000407924 1495 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 QSOX2-201ENST00000358701 4530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GTDC1-219ENST00000542155 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 MFSD14A-201ENST00000370152 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
LHX3Q9UBR4 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms