Protein–RNA interactions for Protein: Q9P1F3

ABRACL, Costars family protein ABRACL, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABRACLQ9P1F3 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AKIP1-206ENST00000525005 1128 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 C2orf69P3-201ENST00000565542 1120 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DZIP1-203ENST00000361396 7418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DAP3-214ENST00000471642 1671 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC009779.2-201ENST00000552576 1443 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SHANK1-204ENST00000391814 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
ABRACLQ9P1F3 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 CNP-201ENST00000393888 2583 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
ABRACLQ9P1F3 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms