Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSA3

CTNNBIP1, Beta-catenin-interacting protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTNNBIP1Q9NSA3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LINC01105-206ENST00000456327 1434 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TNNT1-208ENST00000587465 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 PARP9-204ENST00000471785 3040 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TCTEX1D2-201ENST00000325318 673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 LDLRAP1-201ENST00000374338 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
CTNNBIP1Q9NSA3 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms