Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQ69

LHX9, LIM/homeobox protein Lhx9, humanhuman

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Length 397 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX9Q9NQ69 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ROBO3-221ENST00000543966 1520 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 UBE2N-201ENST00000318066 5186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TCEA1-208ENST00000521604 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
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LHX9Q9NQ69 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
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LHX9Q9NQ69 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KCNQ5-203ENST00000355635 6623 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
LHX9Q9NQ69 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
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