Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY60

GABARAPL3, Gamma-aminobutyric acid receptor-associated protein-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 117 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABARAPL3Q9BY60 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 CPEB3-203ENST00000614585 5789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 SMARCB1-204ENST00000407422 1643 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
GABARAPL3Q9BY60 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MTHFD1L-201ENST00000367307 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PAIP2-208ENST00000511706 468 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC100835.1-201ENST00000565737 498 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAM182B-202ENST00000376404 456 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 YAP1-209ENST00000537274 5350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
GABARAPL3Q9BY60 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms