Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSH3

NICN1, Nicolin-1, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NICN1Q9BSH3 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PLPP7-201ENST00000372261 972 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC004076.1-201ENST00000596831 664 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CCNI2-204ENST00000614847 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC14.97□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.01
NICN1Q9BSH3 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.96□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 LETM2-202ENST00000379957 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
NICN1Q9BSH3 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.95□□□□□ -0.02
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