Protein–RNA interactions for Protein: Q96GA3

LTV1, Protein LTV1 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 475 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTV1Q96GA3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AGAP5-203ENST00000581191 2779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 BLOC1S3-201ENST00000433642 2601 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 UMOD-201ENST00000302509 2477 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
LTV1Q96GA3 PRKAR2A-201ENST00000265563 6471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SLC6A7-203ENST00000524041 2431 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC138932.1-201ENST00000534164 6830 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 RNF34-208ENST00000555076 593 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 AC138696.1-201ENST00000522452 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
LTV1Q96GA3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms