Protein–RNA interactions for Protein: Q8NAA4

ATG16L2, Autophagy-related protein 16-2, humanhuman

Predictions only

Length 619 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG16L2Q8NAA4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MCF2L2-201ENST00000328913 4980 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DNMT3A-205ENST00000402667 2300 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SMAGP-204ENST00000603838 816 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CCDC187-205ENST00000638797 10126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 CEP76-202ENST00000423709 2197 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 FAM157B-201ENST00000446912 1795 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATG16L2Q8NAA4 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms