Protein–RNA interactions for Protein: Q53EU6

GPAT3, Glycerol-3-phosphate acyltransferase 3, humanhuman

Predictions only

Length 434 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GPAT3Q53EU6 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ARID5A-203ENST00000454558 3079 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC096633.1-201ENST00000422446 749 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DAP-202ENST00000432074 1048 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LINC01315-202ENST00000424852 1142 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GPAT3Q53EU6 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms