Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
HIF1AQ16665 PROK1-201ENST00000271331 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 UBALD1-205ENST00000590891 2641 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 OS9-205ENST00000413095 1660 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TBC1D3P5-201ENST00000579401 1545 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HIF1AQ16665 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
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HIF1AQ16665 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 NCAPH2-203ENST00000395701 2077 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ARL13B-203ENST00000394222 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC010460.3-201ENST00000511359 1579 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HIF1AQ16665 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
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