Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LINC02531-201ENST00000404689 593 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 MAP3K13-212ENST00000448876 1681 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 FAM86DP-207ENST00000497543 2152 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC027451.1-201ENST00000530667 553 ntTSL 4 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DECR2-212ENST00000627716 352 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 GPS2-201ENST00000380728 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
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ATP6AP1Q15904 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DHX30-205ENST00000445061 4065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CCR7-203ENST00000579344 1874 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
ATP6AP1Q15904 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
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