Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
HOXA10P31260 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SCARF2-202ENST00000622235 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PTRH1-204ENST00000419060 2692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ALKBH6-202ENST00000378875 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC027088.1-201ENST00000557966 1117 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ORAI2-204ENST00000473939 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC006974.1-201ENST00000637928 1501 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NTRK1-206ENST00000524377 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 STX6-204ENST00000542060 4809 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 POLR2J4-203ENST00000326391 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC012569.1-201ENST00000591191 1524 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC236430.1-201ENST00000402231 743 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 AC244107.1-201ENST00000442033 332 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
HOXA10P31260 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms