Protein–RNA interactions for Protein: P0CE72

OCM, Oncomodulin-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OCMP0CE72 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ALKAL1-202ENST00000523939 536 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MAL-201ENST00000309988 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CDKN1B-202ENST00000396340 897 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 JADE2-211ENST00000612830 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NTAN1-211ENST00000622833 1049 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NTAN1-212ENST00000624579 1115 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 FGFR1OP2-201ENST00000229395 2924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 FSCN1P1-201ENST00000568912 1481 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 PHRF1-203ENST00000416188 5227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RNASE4-203ENST00000555835 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 KIAA1522-201ENST00000294521 878 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
OCMP0CE72 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms