Protein–RNA interactions for Protein: O94889

KLHL18, Kelch-like protein 18, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL18O94889 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CMTM1-204ENST00000336328 606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ARSK-202ENST00000504763 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TLK2-203ENST00000346027 3449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SEH1L-202ENST00000399892 1846 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TOM1L2-207ENST00000535933 1748 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AC008735.1-201ENST00000592252 802 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 DTX3-204ENST00000548804 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 MRPL43-208ENST00000370242 884 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
KLHL18O94889 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms