Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 IKBKB-210ENST00000518983 447 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RPS27A-211ENST00000639844 606 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CDK19-202ENST00000368911 6246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL079301.1-201ENST00000424580 1633 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MORN1-203ENST00000378531 1798 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 BX322234.1-201ENST00000444188 980 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 COX6C-208ENST00000522940 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 OVCH1-AS1-203ENST00000551108 963 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AL355075.4-201ENST00000554988 638 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC117500.2-201ENST00000508145 1561 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 UQCRC1-201ENST00000203407 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 BAALC-201ENST00000297574 801 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VKORC1-204ENST00000394971 664 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SLC6A8-201ENST00000253122 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SPATA20-201ENST00000006658 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SKAP2O75563 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms