Protein–RNA interactions for Protein: B2RPK0

HMGB1P1, Putative high mobility group protein B1-like 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 211 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGB1P1B2RPK0 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 RGS6-210ENST00000553530 5685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
HMGB1P1B2RPK0 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRIM73-202ENST00000430211 1321 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SIGIRR-203ENST00000431843 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PAX4-204ENST00000463946 1613 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC092850.2-201ENST00000623821 2697 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 C17orf50-201ENST00000603305 569 ntTSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 C17orf50-203ENST00000605587 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
HMGB1P1B2RPK0 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms