Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ZSWIM5-201ENST00000359600 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MOK-203ENST00000517966 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 DPYSL3-202ENST00000398514 5309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PITPNC1-201ENST00000299954 6359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 GAB1-201ENST00000262994 2648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CHST11-201ENST00000303694 5709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PCBP4-210ENST00000471622 1784 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
SORCS3Q9UPU3 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms