Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBS4

DNAJB11, DnaJ homolog subfamily B member 11, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJB11Q9UBS4 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ECSIT-207ENST00000588998 818 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SEL1L-204ENST00000555824 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ZNF668-201ENST00000300849 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SMIM19-202ENST00000416469 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 EPN2-203ENST00000395618 2216 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 AQP5-201ENST00000293599 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
DNAJB11Q9UBS4 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AC093734.1-201ENST00000416100 242 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 DYDC2-206ENST00000444807 1173 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AC022424.1-201ENST00000512155 889 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
DNAJB11Q9UBS4 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms