Protein–RNA interactions for Protein: Q9C075

KRT23, Keratin, type I cytoskeletal 23, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRT23Q9C075 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LGMN-216ENST00000557434 1797 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MFSD11-220ENST00000621483 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 UBE3A-201ENST00000232165 5051 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 SMC4-201ENST00000344722 5356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PLBD2-201ENST00000280800 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 UBAP1-203ENST00000379186 2524 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ZNF200-202ENST00000396870 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 GCGR-201ENST00000400723 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 IFFO1-201ENST00000336604 2686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 GMDS-AS1-201ENST00000456943 2308 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 LYPLAL1-201ENST00000366927 1819 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
KRT23Q9C075 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms