Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXW3

SNHG12, Putative uncharacterized protein SNHG12, humanhuman

Predictions only

Length 62 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNHG12Q9BXW3 BMT2-201ENST00000297145 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PIK3R5-216ENST00000584803 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ADD3-202ENST00000356080 3081 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 NOP14-203ENST00000416614 3538 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 USP17L2-201ENST00000333796 1910 ntAPPRIS P1 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CYP26A1-201ENST00000224356 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 XG-201ENST00000381174 2315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PML-203ENST00000354026 2885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RRP1-207ENST00000497547 3022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PHTF1-204ENST00000369604 3273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.5□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PPP1R16B-202ENST00000373331 6106 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RPRD1A-202ENST00000399022 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RUNDC3B-202ENST00000338056 4099 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TTC7A-203ENST00000409245 3033 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 BNIP3-201ENST00000368636 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ZBTB20-215ENST00000481632 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC027612.1-201ENST00000445234 2395 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PABPC1L-204ENST00000255136 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RFT1-202ENST00000394738 1800 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ASL-203ENST00000380839 1765 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TRIM71-201ENST00000383763 8685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 WDR18-202ENST00000585809 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MAPK4-201ENST00000400384 4770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CDKN1C-203ENST00000430149 1570 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AC009237.3-201ENST00000393279 1427 ntBASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 ADAM22-204ENST00000398204 9334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 CTAG1A-201ENST00000593606 993 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 AMIGO2-201ENST00000266581 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SP8-203ENST00000617581 3496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 PTK7-210ENST00000471863 2412 ntTSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 DUS2-207ENST00000565263 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 SYNRG-231ENST00000622045 3859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.49□□□□□ -0.41
SNHG12Q9BXW3 TAS1R3-201ENST00000339381 3433 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.49□□□□□ -0.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms