Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC011445.1-201ENST00000601911 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GXYLT1P5-201ENST00000614548 1189 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC35G2-202ENST00000446465 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC22A1-201ENST00000324965 1521 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TRIM46-203ENST00000368383 2666 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TRAPPC5-201ENST00000317378 790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CD99-203ENST00000381184 918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC009041.2-206ENST00000563863 1728 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 OLFM1-202ENST00000277415 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 WDR74-202ENST00000311713 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 AC091564.2-201ENST00000527191 399 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 CR392000.1-201ENST00000624770 1228 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CENPOQ9BU64 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.2 ms