Protein–RNA interactions for Protein: Q86W47

KCNMB4, Calcium-activated potassium channel subunit beta-4, humanhuman

Predictions only

Length 210 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNMB4Q86W47 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 IFNGR1-201ENST00000367739 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 METRN-205ENST00000568415 612 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC011840.4-201ENST00000578471 627 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 DBP-204ENST00000599385 709 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TPBG-203ENST00000543496 2881 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 METTL9-201ENST00000358154 3256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HEBP2-201ENST00000367697 844 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 KRT18P56-201ENST00000507275 550 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LAT-211ENST00000566177 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CLCN2-205ENST00000457512 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ZDHHC8-202ENST00000334554 5046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 AC005906.2-206ENST00000638180 1029 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
KCNMB4Q86W47 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 USF2-202ENST00000343550 1523 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SLC2A5-201ENST00000377414 2344 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
KCNMB4Q86W47 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms