Protein–RNA interactions for Protein: Q16720

ATP2B3, Plasma membrane calcium-transporting ATPase 3, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP2B3Q16720 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RAI2-203ENST00000415486 2037 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TMEM42-201ENST00000302392 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 IFFO1-202ENST00000356896 2680 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 ITM2B-201ENST00000378549 805 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ATP2B3Q16720 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 AC023511.2-201ENST00000618803 211 ntBASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
ATP2B3Q16720 TAL1-202ENST00000371884 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
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