Protein–RNA interactions for Protein: Q14008

CKAP5, Cytoskeleton-associated protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 2,032 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKAP5Q14008 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NECTIN1-202ENST00000340882 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PFN4-201ENST00000313213 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RFX3-AS1-201ENST00000423112 552 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PYCR1-207ENST00000577756 1144 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ZNF205-206ENST00000620094 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GLS-201ENST00000320717 4834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 GRIN3B-201ENST00000234389 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PANK1-201ENST00000307534 6976 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NUTM2F-202ENST00000341207 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 NUTM2G-202ENST00000372322 2516 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
CKAP5Q14008 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
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