Protein–RNA interactions for Protein: Q13310

PABPC4, Polyadenylate-binding protein 4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PABPC4Q13310 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.86e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.521e-19■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.281e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-204ENST00000409766 2033 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.161e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.971e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.881e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-220ENST00000613444 2161 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-207ENST00000450066 2086 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.151e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-210ENST00000459775 2148 ntTSL 211.71□□□□□ -0.541e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 USP39-216ENST00000490193 1028 ntTSL 510.18□□□□□ -0.781e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 H3F3B-203ENST00000586518 1701 nt33.13■■■□□ 2.891e-12■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.376e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LYRM4-204ENST00000463032 1487 ntTSL 1 (best)15.77■□□□□ 0.116e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LYRM4-205ENST00000464010 1401 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.036e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LYRM4-201ENST00000330636 7312 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.07□□□□□ -0.966e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.583e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.58e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 KDELR2-201ENST00000258739 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.128e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NFE2L1-203ENST00000362042 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.052e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NFE2L1-222ENST00000585291 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.132e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NFE2L1-202ENST00000361665 4729 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.182e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 KDELR2-205ENST00000463747 376 ntTSL 513.16□□□□□ -0.38e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NFE2L1-201ENST00000357480 4672 ntTSL 1 (best) BASIC12.88□□□□□ -0.352e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 KDELR2-203ENST00000454368 2478 ntTSL 211.82□□□□□ -0.528e-10■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 EEF2-207ENST00000600794 352 ntTSL 311.23□□□□□ -0.611e-52■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RPL37A-211ENST00000598925 775 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.286e-48■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.286e-48■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RPL37A-206ENST00000456586 401 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.286e-48■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RPL37A-204ENST00000441179 529 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.786e-48■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DCAF6-201ENST00000312263 3186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.143e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DCAF6-203ENST00000367843 3302 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.143e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DCAF6-204ENST00000432587 3522 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.183e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DCAF6-202ENST00000367840 3349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.09□□□□□ -0.953e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 DCAF6-211ENST00000489398 1727 ntTSL 28.89□□□□□ -0.993e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPSM3-208ENST00000472768 1417 ntTSL 222.48■■□□□ 1.192e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RUVBL2-211ENST00000601968 1641 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.153e-31■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 RUVBL2-204ENST00000594338 1853 ntTSL 521.42■■□□□ 1.023e-31■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LMBR1L-205ENST00000547670 1866 ntTSL 1 (best)20.37■□□□□ 0.852e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 IMP4-201ENST00000259239 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.836e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.832e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.771e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ERCC1-214ENST00000592083 938 ntTSL 518.14■□□□□ 0.494e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 LMBR1L-220ENST00000551272 472 ntTSL 217.84■□□□□ 0.452e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.392e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 IMP4-207ENST00000460100 721 ntTSL 317.19■□□□□ 0.346e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPSM3-209ENST00000487761 1460 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.292e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 EGLN2-212ENST00000595621 758 ntTSL 315.45■□□□□ 0.062e-6■■■□□ 14.9
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PABPC4Q13310 LMBR1L-218ENST00000551143 578 ntTSL 314.79□□□□□ -0.042e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GPSM3-210ENST00000619085 1177 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.32e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 IMP4-214ENST00000475074 512 ntTSL 212.83□□□□□ -0.366e-7■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 ANAPC15-212ENST00000543015 500 ntTSL 210.07□□□□□ -0.85e-8■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 COX4I1-212ENST00000566617 572 ntTSL 433.74■■■□□ 2.992e-26■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 YBX3-202ENST00000279550 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.352e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.992e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 YBX3-208ENST00000540447 6393 ntTSL 29.13□□□□□ -0.952e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 YBX3-210ENST00000540975 677 ntTSL 38.93□□□□□ -0.982e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.643e-11■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 POLD1-208ENST00000596648 1048 ntTSL 522.81■■□□□ 1.242e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 POLD1-202ENST00000593407 867 ntTSL 522.24■■□□□ 1.152e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.032e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-202ENST00000464720 1665 ntTSL 1 (best)21.07■□□□□ 0.962e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-211ENST00000611517 1613 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.532e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-210ENST00000608611 1511 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.512e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-205ENST00000470223 2841 ntTSL 215.95■□□□□ 0.142e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 TMEM222-206ENST00000471456 2861 ntTSL 215.3■□□□□ 0.042e-6■■■□□ 14.9
PABPC4Q13310 NAA10-213ENST00000478177 573 ntTSL 1 (best)23.53■■□□□ 1.362e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.754e-26■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 CALM3-205ENST00000486500 2536 ntTSL 213.81□□□□□ -0.24e-26■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.111e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.11e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 NUP98-220ENST00000533346 580 ntTSL 211.81□□□□□ -0.521e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 LINC01029-203ENST00000582805 788 ntTSL 1 (best)17.94■□□□□ 0.463e-9■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-206ENST00000439994 671 ntTSL 528.19■■■□□ 2.11e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-207ENST00000460939 1770 ntTSL 525.61■■□□□ 1.691e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-203ENST00000394776 2818 ntTSL 220.45■□□□□ 0.861e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.851e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.711e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.651e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.361e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 EML3-213ENST00000494448 3665 ntTSL 215.59■□□□□ 0.091e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC19.66■□□□□ 0.741e-10■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.969e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.929e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 RNF5-203ENST00000375094 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.392e-8■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.541e-67■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 ATP5L-204ENST00000529460 457 ntTSL 313.16□□□□□ -0.39e-12■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 ATP5L-207ENST00000533172 336 ntTSL 212.32□□□□□ -0.449e-12■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 ATP5L-205ENST00000529770 575 ntTSL 27.73□□□□□ -1.179e-12■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 ATP5L-206ENST00000529790 900 ntTSL 27.23□□□□□ -1.259e-12■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.964e-10■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.594e-10■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 URM1-203ENST00000372853 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.43□□□□□ -0.421e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 URM1-204ENST00000452446 2944 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.591e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 URM1-202ENST00000372850 3045 ntTSL 1 (best) BASIC10.44□□□□□ -0.741e-6■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC39A3-205ENST00000589363 524 ntTSL 323.39■■□□□ 1.331e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.831e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 SLC39A3-204ENST00000589166 491 ntTSL 212.06□□□□□ -0.481e-7■■■□□ 14.8
PABPC4Q13310 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.431e-6■■■□□ 14.8
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