Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF419-205ENST00000424930 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MST1R-214ENST00000613534 2025 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ELOC-209ENST00000602840 2780 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SERPINF2-202ENST00000382061 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TFAP2A-AS1-201ENST00000420777 1575 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LRRC58-201ENST00000295628 7903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PPP2R2C-209ENST00000515571 1832 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 POLR1D-220ENST00000637071 1943 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CNTN1Q12860 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 FAM110D-201ENST00000374268 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 GDF10-201ENST00000580279 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 PTPRJ-202ENST00000440289 3158 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CNTN1Q12860 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
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