Protein–RNA interactions for Protein: Q03989

ARID5A, AT-rich interactive domain-containing protein 5A, humanhuman

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID5AQ03989 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PML-221ENST00000569965 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MON2-203ENST00000546600 6130 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SPDYE13P-201ENST00000445314 798 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC132872.2-201ENST00000581303 2368 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TUBB2B-201ENST00000259818 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC005625.1-201ENST00000590304 472 ntTSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 IGF2-205ENST00000416167 5585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 HSF2-202ENST00000452194 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 VRK1-201ENST00000216639 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ARID5AQ03989 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.4 ms