Protein–RNA interactions for Protein: P36954

POLR2I, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB9, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2IP36954 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZFP64-205ENST00000371518 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MCHR1-202ENST00000381433 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 VASH1-204ENST00000554743 1096 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PSMC3IP-208ENST00000590760 664 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RBP4-202ENST00000371467 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PBK-203ENST00000522944 1499 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 VASH1-201ENST00000167106 5728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC027312.1-201ENST00000523591 1571 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 GSTZ1-204ENST00000393734 1424 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
POLR2IP36954 SPTBN4-204ENST00000392025 8671 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.8 ms