Protein–RNA interactions for Protein: P10914

IRF1, Interferon regulatory factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRF1P10914 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
IRF1P10914 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
IRF1P10914 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CCNJL-203ENST00000393977 3320 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FBF1-204ENST00000586631 621 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CALM3-201ENST00000291295 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GCAT-202ENST00000323205 1656 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 EWSR1-202ENST00000332035 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CHRNG-201ENST00000389492 1398 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC108751.1-201ENST00000490852 363 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ZNF213-202ENST00000416391 2996 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NAT6-205ENST00000443842 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ISYNA1-202ENST00000457269 1703 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SMAD4-201ENST00000342988 8769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NPEPL1-204ENST00000525967 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
IRF1P10914 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms