Protein–RNA interactions for Protein: I3L3R5

CCER2, Coiled-coil domain-containing glutamate-rich protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCER2I3L3R5 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC111152.3-201ENST00000569699 673 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CCER2I3L3R5 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 CHRNA4-201ENST00000370263 5577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
CCER2I3L3R5 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19 ms