Protein–RNA interactions for Protein: Q9UG01

IFT172, Intraflagellar transport protein 172 homolog, humanhuman

Predictions only

Length 1,749 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFT172Q9UG01 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NFIB-208ENST00000397581 3318 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ZBTB16-201ENST00000335953 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 VGLL4-211ENST00000430365 1377 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TNFAIP1-202ENST00000544907 1656 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RN7SL589P-201ENST00000481268 310 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ADRA1A-206ENST00000380586 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 LTC4S-201ENST00000292596 666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC124067.2-201ENST00000521989 510 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ERCC1-212ENST00000591636 836 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CCDC28B-202ENST00000421922 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AP001059.3-201ENST00000619053 235 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 SPERT-201ENST00000310521 1613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
IFT172Q9UG01 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 AC108449.3-201ENST00000560714 585 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
IFT172Q9UG01 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.2 ms