Protein–RNA interactions for Protein: Q9UD57

NKX1-2, NK1 transcription factor-related protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKX1-2Q9UD57 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CD58-203ENST00000457047 1328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 KIFC3-206ENST00000541240 3047 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TMEM255B-202ENST00000375353 6100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ANKRD65-202ENST00000442470 876 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LGR4-203ENST00000480977 492 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PSME3-210ENST00000590720 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PTGIR-202ENST00000594275 699 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PTGIR-206ENST00000598865 724 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TACO1-201ENST00000258975 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 EDNRA-206ENST00000511804 1569 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 RPS14-201ENST00000312037 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HCFC1R1-202ENST00000354679 765 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 HSD17B10-202ENST00000375298 823 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 AC008040.2-201ENST00000461049 708 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ALDH3A2-224ENST00000626500 995 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
NKX1-2Q9UD57 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms