Protein–RNA interactions for Protein: Q9NPG1

FZD3, Frizzled-3, humanhuman

Predictions only

Length 666 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD3Q9NPG1 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ASPRV1-201ENST00000320256 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC068888.1-203ENST00000546566 1650 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC087645.2-201ENST00000586321 799 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC064836.3-201ENST00000607928 673 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 LINC00574-201ENST00000420557 2318 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 INVS-203ENST00000374921 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 CHAC1-204ENST00000617768 1560 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
FZD3Q9NPG1 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TMEM37-201ENST00000306406 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HAPLN3-204ENST00000562889 1547 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PF4-201ENST00000296029 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 DYRK1B-203ENST00000430012 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
FZD3Q9NPG1 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms