Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUW7

C9orf16, UPF0184 protein C9orf16, humanhuman

Predictions only

Length 83 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf16Q9BUW7 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 SCP2-202ENST00000371513 2003 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
C9orf16Q9BUW7 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AL031600.3-201ENST00000566287 1124 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC009052.1-201ENST00000567090 298 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CACNA2D1-203ENST00000423588 1429 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SDC1-203ENST00000403076 1523 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KLC1-206ENST00000389744 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DCLK2-201ENST00000296550 4265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 COL17A1-202ENST00000369733 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 IL34-201ENST00000288098 1607 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NDUFA8-201ENST00000373768 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC026366.1-201ENST00000488803 879 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NEK2-205ENST00000540251 1318 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 OGFOD2-222ENST00000545317 1481 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SMC4-204ENST00000462787 5033 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CHKA-201ENST00000265689 2530 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MINDY1-201ENST00000312210 2400 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 THNSL2-203ENST00000377254 1560 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
C9orf16Q9BUW7 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms