Protein–RNA interactions for Protein: Q96S37

SLC22A12, Solute carrier family 22 member 12, humanhuman

Predictions only

Length 553 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC22A12Q96S37 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 SIGIRR-201ENST00000332725 1639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 FLT1-207ENST00000615840 6453 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 SNTG2-202ENST00000407292 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SLC22A12Q96S37 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 C16orf59-204ENST00000563531 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SH3TC1-202ENST00000382521 829 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LYRM1-209ENST00000568663 857 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 STX10-207ENST00000589083 1241 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 USP48-201ENST00000308271 4595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 NUTM2D-201ENST00000381697 3290 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AC099684.1-202ENST00000425277 1747 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SARS2-212ENST00000600042 1630 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 LYPLA2-205ENST00000374514 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 DFFA-201ENST00000377036 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 GMDS-AS1-205ENST00000529893 900 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SLC22A12Q96S37 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms